La línea editorial del Museo se fundamenta en dos tipologías de publicaciones. Por un lado, los llamados Quaderns del Museu Frederic Marès, colección iniciada en 1994 como publicaciones periódicas, que han acabado convirtiéndose en los catálogos de las exposiciones temporales del Museo y que desde 2004 se editan mayoritariamente en versión trilingüe (catalán, castellano e inglés). Por otro, los Catálogos de fondo, catálogos razonados de las colecciones del Museo, de los que ya se han editado 5 volúmenes.

El Museo edita otras publicaciones de divulgación general como la Guía del Museo Frederic Marès (catalán, castellano e inglés)